表面等離子共振分子互作BIACORE的原理
首先先了解幾個術(shù)語和定義:
表面等離子共振(Surface Plasmon Resonance,SPR)
一、消逝波
當光從光密介質(zhì)入射到光疏介質(zhì),入射角增加到某一角度,使折射角達到90°時,折射光將完全消失,而只剩下反射光,這種現(xiàn)象叫做全反射。
當以波動光學的角度來研究全反射時,人們發(fā)現(xiàn)當入射光到達界面時并不是直接產(chǎn)生反射光,而是先透過光疏介質(zhì)約一個波長的深度,再沿界面流動約半個波長再返回光密介質(zhì)。則透過光疏介質(zhì)的波被稱為消逝波。
如下圖所示。
全反射時如圖中所示沿X軸方向振幅衰減的一個波,即入射光波在反射面不立即消失,而是投射進入光疏介質(zhì)一定深度,且振幅在垂直方向呈指數(shù)衰減,這種電磁波叫消逝波。
二、等離子波
把金屬表面的價電子看成是均勻正電荷背景下運動的電子氣體,其中正、負帶電粒子數(shù)目幾乎相等,這實際上也是一種等離子體。當金屬受電磁干擾時,金屬內(nèi)部的電子密度分布會變得不均勻。因為庫侖力的存在,會將部分電子吸引到正電荷過剩的區(qū)域,被吸引的電子由于獲得動量,故不會在引力與斥力的平衡位置停下而向前運動一段距離,之后電子間存在的斥力會迫使已經(jīng)聚集起來的電子再次離開該區(qū)域。由此會形成一種整個電子系統(tǒng)的集體震蕩,而庫侖力的存在使得這種集體震蕩反復進行,進而形成的震蕩稱等離子震蕩,并以波的形式表現(xiàn),稱為等離子波。
三、SPR光學原理
光在棱鏡與金屬膜表面上發(fā)生全反射現(xiàn)象時,會形成消逝波進入到光疏介質(zhì)中,而在介質(zhì)中又存在一定的等離子波。當兩波相遇時可能會發(fā)生共振。當消逝波與表面等離子波發(fā)生共振時,檢測到的反射光強會大幅度地減弱。能量從光子轉(zhuǎn)移到表面等離子,入射光的大部分能量被表面等離子波吸收,使反射光的能量急劇減少。
可以從反射光強響應(yīng)曲線看到一個最小的尖峰,此時對應(yīng)的入射光波長為共振波長,使反射光完全消失的入射角就是SPR角。SPR角隨金膜表面折射率變化而變化,而折射率的變化又與金膜表面結(jié)合的分子質(zhì)量成正比。因此可以通過對生物反應(yīng)過程中SPR角的動態(tài)變化獲取分子之間相互作用的特異信號。
SPR生物傳感器的光源為偏振光(polarized light),傳感芯片(sensor chip)表面鍍有一層金膜,實驗時,先將一種生物分子(ligand)固定在金膜表面,然后將與之相互作用的分子(analyte)溶于溶液(或混合液)流過芯片表面。SPR檢測器能跟蹤溶液中的分子與芯片表面的分子結(jié)合、解離整個過程的變化,不同角度的反射光的光強被記錄后得到角度-光強曲線圖,每條曲線的波谷即為該曲線的共振角,共振角對應(yīng)的角度為共振信號(resonance signal),時間與對應(yīng)共振信號的曲線即為SPR傳感圖(sensorgram)。
表面等離子共振生物分子相互作用分析儀(BIACORE)的原理
當一束光線通過棱鏡射向金屬表面,在金屬發(fā)生全反射現(xiàn)象時,會在金屬膜中產(chǎn)生消逝波,消逝波與表面等離子波發(fā)生共振時,檢測到的反射光強會大幅度地減弱。此時對應(yīng)的入射光波長為共振波長,對應(yīng)的入射角為共振角,即SPR角。SPR角隨著金屬表面折射率的變化而變化,而折射率的變化又與金屬表面結(jié)合的分子質(zhì)量成正比。
Biacore的核心組件就是由微流路系統(tǒng),光學組件及金膜芯片組成。金膜芯片上的蛋白和流路中的分子結(jié)合有解離的過程中,SPR角就會隨之發(fā)生變化,檢測器檢測到這種變化,根據(jù)此變化曲線作圖分析,可得出分子間的結(jié)合常數(shù)Ka、解離常數(shù)Kd或親和力常數(shù)KD。
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以免疫學分析為例,在金膜表面固定某種受體(如抗體)然后流過含相應(yīng)配體(如抗原)的樣品,配體與受體的結(jié)合將使金膜與溶液界面的折射率上升,從而導致共振角發(fā)生變化。為了表述的方便,共振角(或共振信號)可以用共振單位(resonance units,RU)來表示。對大多數(shù)生物分子而言,1000RU大約等于1mm2的面積上有1ng的質(zhì)量變化,相當于溶液中蛋白濃度為6mg/mL。SPR生物傳感器通過檢測獲得共振角的改變程度,便可以對配體濃度進行定量。
? SPR 是一種折光率傳感器,其響應(yīng)值反映了SPR角度的改變?
? 響應(yīng)信號依賴于芯片表面分子的濃度和溫度?
? 1 RU 的響應(yīng)值大致上相當于芯片表面結(jié)合物質(zhì)的濃度改變了1 pg/mm2 (蛋白結(jié)合與CM5芯片)?
如下圖所示。
Biacore的核心組件包括:
SPR生物傳感技術(shù)的應(yīng)用領(lǐng)域包括:生物大分子的相互作用;腫瘤研究;免疫學和傳染病;神經(jīng)科學;生物制藥;蛋白質(zhì)組學。
Biacore可研究的生物分子范圍包括:蛋白質(zhì);DNA/RNA;脂類/脂質(zhì)體/生物膜;多糖;多肽;小分子;全細胞病毒/微生物。
可分析的對象:
Biacore核心組件
Biacore提供的生物分子相互作用信息包括:
有無結(jié)合(Yes or no)
結(jié)合的特異性和選擇性(Specificity)
兩種分子的結(jié)合強度-親和力(Affinity)
結(jié)合和解離的快慢和復合體的穩(wěn)定性-動力學(Kinetics)
功能復合體形成的參與者、協(xié)同者和組裝順序(Mechanism)
分子結(jié)合的溫度與熱力學特征(Thermodynamics)
目標分子活性含量的檢測(Concentration)
SPR光學組件
微流控系統(tǒng)(IFC)具有的特性包括:集成化、自動化的微流路控制系統(tǒng);樣品消耗量低;為互相作用分析而設(shè)計優(yōu)化
微流控系統(tǒng)(IFC)-流動池的特點為:
IFC上有4個流動池;可選擇單獨、配對、串聯(lián)使用。流動池為配對使用進行了優(yōu)化(Fc1-Fc2,F(xiàn)c3-Fc4)
傳感芯片:
葡聚糖表面的特點:親水性;溫和型:和2%濃度的葡聚糖水溶液環(huán)境相似;非特異性結(jié)合量低;高結(jié)合容量;易于進行共價結(jié)合;出色的化學穩(wěn)定性。
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傳感芯片的選擇:
11種不同的芯片種類
CM5,CM4,CM3:芯片、蛋白、肽段、小分子等
CM7:小分子化合物研究
SA芯片:生物素標記的分子,如核酸、糖類等
Biotin CAP芯片:可逆性生物素捕獲芯片心
NTA芯片:His重組蛋白
L1芯片:模擬脂質(zhì)雙分子層環(huán)境
HPA芯片:實現(xiàn)膜系統(tǒng)相關(guān)的互作分析
C1芯片:研究細胞、病毒等大顆粒分子
Au裸金芯片:客戶定制表面(材料、高分子等)
30余種不同的試劑盒及緩沖液產(chǎn)品:
氨基偶聯(lián)試劑盒、巰基偶聯(lián)試劑盒;
GST捕獲試劑盒 GST重組蛋白分析
NTA捕獲試劑盒 His重組蛋白分析?
最常用的傳感器芯片:
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Biacore實驗的基本流程
分析物和配體的定義
芯片表面預處理 – 偶聯(lián)/固定配體 (Immobilization)?
–什么是固定配體??
–將配體直接(共價)或者間接地 (通過捕獲分子) 固定于芯片表面;或稱為偶聯(lián)蛋白:在芯片表面偶聯(lián)分子Ligand或捕獲分子?
樣品進樣(Injection)的過程為:
分析物(Analyte)進樣后,以恒定的流速和濃度流過芯片表面
樣品中的待分析物與固定在芯片表面上的配體發(fā)生結(jié)合,芯片表面物質(zhì)的質(zhì)量發(fā)生改變,儀器記錄下對應(yīng)的響應(yīng)值(response)的改變
進樣結(jié)束后,切換緩沖液流過芯片表面,分析物由配體上自發(fā)解離,解離的進程由響應(yīng)值實時監(jiān)控
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芯片再生(Regeneration)的過程為:
將自發(fā)解離后仍然結(jié)合于配體的分析物徹底洗掉
配體的結(jié)合活性必須保留。
傳感圖(The sensorgram)
實驗設(shè)計
選用CM5傳感芯片→在金膜表面固定表達純化后的D結(jié)構(gòu)域蛋白→流過含抗體的樣品→抗體與D結(jié)構(gòu)域蛋白的結(jié)合將使金膜與溶液界面的折射率上升,從而導致共振角發(fā)生變化→檢測蛋白與抗體的結(jié)合情況。
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